L’identification des protéines peut être réalisée sur plusieurs types d’échantillons :
– échantillons complexes comme des extraits protéiques totaux (tissus, cellules, liquides physiologiques), de sous-protéomes ou d’interactomes par exemple (éluats d’immunoprécipitation, de co-immunoprécipitation ou de pull-down)
– protéines/peptides de synthèse ou purifiés par chromatographie
Selon la complexité et le tampon dans lequel sont solubilisés vos protéines, un traitement adapté des échantillons sera appliqué (séparation SDS-PAGE, dessalage, fractionnement, etc.)
Étapes de la prestation d’identification protéique
- Traitement de l’échantillon
- Digestion des protéines
- Dessalage des peptides
- Injection en LC-MS/MS
- Analyse des données
Livrables
- Liste de protéines identifiées (format Excel)
En pratique : n’hésitez pas à nous contacter pour en savoir plus à medecine-p3s@sorbonne-universite.fr ou au 01.40.77.81.32