Quantification

Les analyses  LC-MS/MS permettent de quantifier de façon relative l’ensemble des protéines identifiées dans  les différentes conditions biologiques étudiées.

La quantification est habituellement réalisée sur les protéines  sans marquage isotopique préalable : on parle de quantification en label-free.

Selon la complexité des échantillons, un fractionnement sera proposé pour une analyse plus approfondie du protéome.

Étapes de la prestation de quantification protéique

  • Fractionnement (optionnel)
  • Digestion protéique
  • Dessalage des peptides
  • Injection en LC-MS/MS
  • Analyse quantitative des données

 

Livrables

  • Liste de protéines différentiellement exprimées et significatives (format Excel)

En pratique : n’hésitez pas à nous contacter pour en savoir plus à medecine-p3s@sorbonne-universite.fr ou au 01.40.77.81.32

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