Les analyses LC-MS/MS permettent de quantifier de façon relative l’ensemble des protéines identifiées dans les différentes conditions biologiques étudiées.
La quantification est habituellement réalisée sur les protéines sans marquage isotopique préalable : on parle de quantification en label-free.
Selon la complexité des échantillons, un fractionnement sera proposé pour une analyse plus approfondie du protéome.
Étapes de la prestation de quantification protéique
- Fractionnement (optionnel)
- Digestion protéique
- Dessalage des peptides
- Injection en LC-MS/MS
- Analyse quantitative des données
Livrables
- Liste de protéines différentiellement exprimées et significatives (format Excel)
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